Das Selma Stern Zentrum steht sowohl für die transdisziplinäre Vernetzung von Jüdischen Studien, als auch für die Förderung des Dialoges in der Forschungslandschaft im Raum Berlin-Brandenburg. Das zentrale Anliegen besteht darin, die Pluralität bereits bestehender Forschung erkennbar zu machen und Synergien zwischen den Forschenden und den Forschungseinrichtungen mit einem breiten Kooperationsangebot zu intensivieren. Charakteristisch dafür ist die Konstitution des Zentrums: Erstmalig in der Geschichte der Berlin-Brandenburger Wissenschaft wurde von fünf Universitäten und zwei Forschungseinrichtungen der Region in einem Gemeinschaftsakt eine Einrichtung Jüdischer Studien ins Leben gerufen. Zu den Trägereinrichtungen gehören die Freie Universität Berlin, die Humboldt-Universität zu Berlin, die Technische Universität Berlin, die Universität Potsdam, Europa-Universität Viadrina Frankfurt (Oder) (seit 2014) sowie das Abraham Geiger Kolleg und das Moses Mendelssohn Zentrum für europäisch-jüdische Studien.